谜底是石榴。
谜语中的坛子、饺子、珠子都是比喻修辞中的喻体，根据石榴的结构特点可知，石榴的外皮比喻为坛子，石榴的果实比喻为饺子，石榴的籽粒比喻为珠子，正好能够解答此谜语。
石榴是一种落叶乔木或灌木，通常对生或簇生，无托叶，花顶生或近顶生，单生或几朵簇生或组成聚伞花序，浆果球形，顶端有宿存花萼裂片，果皮厚，种子多数，浆果近球形，果熟期九至十个月，外种皮肉质半透明，多汁，内种皮革质。
中国栽培石榴的历史，可上溯至汉代，据陆巩记载是张骞从西域引入。
中国南北都有栽培，以安徽、江苏、河南等地种植面积较大，并培育出一些较优质的品种。
谜语一边绿、一边红、一边怕虫、一边怕水，谜底是秋，因为秋字是“禾”和“火”组成，禾是庄稼，对应一边绿；火是红色的，对应一边红；禾怕虫，火怕水，即为秋。
秋的相关补充：
1.作名词，意为一年四季中的第三季，秋季。
组词为深秋、秋高气爽、一叶知秋。
2.作动词，意为庄稼成熟。
组词为稻秋、麦秋。
3.作形容词，意为秋天的。
组词为秋风、秋雨、秋色。
此题的谜底应是一种水果，答案就是石榴。
石榴的外形就像一个坛子，里面的一个又一个小颗粒就是“饺子”。
每吃掉一颗小石榴颗粒，就会吐出里面的白色的种子。
所以此题谜底为石榴。
另外补充一点，如果此题是这样的“小小黄坛子,装满黄饺子,吃掉黄饺子,吐出白珠子”，那么谜底就是橙子。
因为橙子的皮和果肉都是黄色的，种子是白色的。
这种类型的题目如果根据水果的不同外形和颜色来出题，就会有不同的答案。