目的基因主要是指编码蛋白的基因，例如与生物抗逆性相关的基因，与优良品质相关的基因，与生物药物和保健品相关的基因，与毒物降解相关的基因，以及与工业所需用酶相关的基因等，也可以是一些具有调控作用的因子。
“有调控作用的因子”指启动子、终止子、增强子等调控序列以及非编码区域在内的一个广泛定义。
发生在细胞外。
用同一种限制性内切酶剪切目的基因和运载体，形成相同的粘性末端，再用DNA链接酶使目的基因和运载体相连，通过标记基因筛选出需要的目的基因和运载体的结合体，可用CaCl2处理细胞，增加细胞的通透性，使其进入细胞，最终在细胞内表达，动物细胞还可用灭火的仙台病毒使动物细胞的通透性增加，使其进入细胞。
<基因的稳定遗传取决于两个重要的环节，一是基因的复制，二基因的表达。
只有这两个环节做到了，才能稳定遗传。
这中间RNA起着至关重要的角色。
要确定目的基因导入受体细胞后是否能稳定遗传并表达，需要经过以下步骤进行检测：
1.首先要检测转基因生物的染色体DNA上是否插入了目的基因，方法是采用DNA分子杂交技术。
2.其次还要检测目的基因是否转录出mRNA，方法是用标记的目的基因作探针与mRNA杂交。
3.最后检测目的基因是否翻译成蛋白质，方法是从转基因生物中提取蛋白质，用相应的抗体进行抗原和抗体杂交。
4.有时还需进行个体生物学水平的鉴定。
如转基因抗虫植物是否出现抗虫性状。