鸡下软皮蛋有多种原因造成：
1.缺乏磷、钙等微量元素造成的，比较好解决补充骨粉、鱼粉即可；
2.惊吓造成，找到惊吓原；如狗、猫、黄鼠狼进入鸡舍或公鸡的比例太高；
3.疾病造成，如禽流感、新城疫、滴虫病、白痢等都可以造成鸡下软皮蛋。
因为鸡后部只有肛门和外界相通，所以鸡蛋和粪便尿液，最后都是要通过肛门才能能排出体外。
但是鸡蛋和粪尿在到达肛门之前，是分别通过消化道和生殖道两个不同的系统，虽然鸡蛋也是通过肛门排出鸡蛋，但是很少会接触粪便，就算有也没事，鸡蛋还有蛋壳的包覆，是不会污染到内部的。
缺乏钙，会导致鸡下软皮蛋，磷或维生素D3，而钙是形成蛋壳和骨骼的主要成分，磷同钙一起构成骨骼和蛋壳，其余的分配在全身组织中，具有广泛的生理作用。
炎热的夏季，如果蛋鸡不喂小苏打也可引起软皮蛋。
如果鸡患有肠道疾病，比如肠道发炎等，也是导致下软蛋的原因。