蛋白质亚基之间的相互作用不包含共价连接。

蛋白质亚基是组成蛋白质四级结构的一部分。

蛋白质或酶的生物学活性一般需要完整的结构形成一段功能区域 ，而一段亚基可能无法构成完整的功能区域 ，故单独的亚基可能无法具有生物学活性。

蛋白质的第四级结构是由蛋白质亚基的立体排布和亚基之间次级键的连接组成的空间结构。

亚基主要是依靠非共价键结合的，第三级结构多肽链之间通过二硫键相互结合。

组成一个大分子复合物的各种亚基可以相同也可以不同。