首先要打完茵郁市的道馆，然后往右走，从121号道路下方冲浪去送神火山，进入送神火山一层后往左走，出去来到送神火山的外部，然后往上走，在山顶开到水舰队的老大，他会离开。
然后从旁边的老奶奶那里获得火岩队之证，然后从112号道路坐缆车去烟突山下面的凹凸山道，在中部的位置会出现火岩队基地的入口。
在里面打完火岩队并唤醒古拉顿之后去凯那市右上角坐船的地方触发水舰队偷走潜水艇的剧情，然后水静市右上角的水舰队基地就可进入，在里面打完后水舰队的人会乘坐潜水艇逃走，拿走大师球。
出基地，124号水路就可渡过，通过124号水路后就是绿岭市。
步骤如下：玩家需要去第八道馆城市上方的源初之山山顶打败银河团老大赤日。
打完之后再去永冻之窟深处的极寒之渊里打败等离子团的老大盖奇斯。
然后回到现实世界的梦之实验室里，和博士、主角的父母和副主角见面。
之后回到第二世界，去挑战梦世界联盟，挑战胜利之后第二世界的任务结束。
1、远方小岛的船票：一周目去水静市，到右下角灯塔下方，水手会赠送船票。
2、梦幻船票：二周目结束后，打通关梦剧情即可拿到梦幻岛的船票。
3、去对战开拓区的船票：一周目通关后，主角的父亲会赠送船票。
注：第一张船票是抓另外一只水督的，第二张船票是抓梦幻的，第三张船票可以去开拓区。