上海交通大学医学院附属医院共有9个，分别为：上海交通大学附属瑞金医院、上海交通大学附属新华医院、上海交通大学附属仁济医院、上海交通大学附属胸科医院、上海交通大学附属第一人民医院、上海交通大学附属第三人民医院、上海交通大学附属第六人民医院、上海交通大学附属第九人民医院、上海交通大学医学院附属儿童医院。
上海交通大学医学院从2011年开始每年都会在陕招收学生，招收一批次理科，一批次文科，一批次理科，护理学理科和文科。
上海交通大学医学院原名上海第二医科大学，其前身是由圣约翰大学医学院、震旦大学医学院、同德医学院、于1952年全国高等学校院系调整时合并而成的上海第二医学院，1985年更名为上海第二医科大学，1997年，学校通过了211工程立项。
在2005年7月18日，上海交通大学与上海第二医科大学合并，更名为上海交通大学医学院。
隶属于上海交通大学，在最新的教育部组织的学科评估中，上海交通大学医学院临床医学排名全国第一，口腔医学排名第二，基础医学排名第三，护理学排名第五，综合实力位居中国顶尖医学院第一方阵。
上海交通大学医学院附属卫生学校创建于1957年，为社会培养了大量的护士、检验士、医士、放射技士、药剂士、口腔医士、口腔工艺技士、生物医学工程技士、医学美容技士、医疗保险技士等各类卫生职业技术人才。
专业设置：学校以就业为导向，设立了一批医工、医文复合型特色专业，有护理学、医学检验、口腔工艺技术、眼视光技术、卫生保健。
护理专业为国家级重点示范专业，经上海市教委批准，成为本市首个卫生类中外合作教育项目。
医学检验为上海市重点示范专业。
学校荣誉：上海市卫生系统惟一四次蝉联国家级重点中等职业学校。
上海市医学类中专首个由政府批准的中外合作办学项目学校。
全国职教先进单位。
上海市文明单位。
上海市职教先进单位。
上海市行为规范学校。
上海市艺术特色学校。