在中国大陆地区的教科书中，均将微生物分为以下8大类： 细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次体、支原体、衣原体、螺旋体。
西方与日本的教科书与上面大同小异。
另外广义的微生物还会将原生动物门中的一些及其一些微浮游动物和微藻（也就是单细胞植物）包括进来。
1.真核细胞型微生物，即为有真正细胞核的微生物。
特点：细胞核分化程度高，有核膜和核仁，细胞器完整；
2.原核细胞型微生物，即没有真正细胞核的微生物，只有拟核。
特点：细胞核的分化较低，仅有原始核，无核膜、核仁。
细胞器很不完善。
DNA和RNA同时存在；
3.非细胞型微生物，即没有细胞核的微生物。
特点：无典型的细胞结构，只能寄生在活细胞内生长繁殖。
核酸类型为DNA或RNA。
微生物是一切肉眼看不见或看不清楚的微小生物的总称。
它们是一些个体微小、构造简单的低等生物。
大多为单细胞，少数为多细胞，还包括一些没有细胞结构的生物。
在中国，微生物被划分为以下8大类：细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次体、支原体、衣原体、螺旋体。