1.植物蛋白与动物蛋白在氨基酸组成和数量上存在一定差异。
虽然植物蛋白来源广泛，但蛋白质的种类和人体的相对数量有一定的差距之间的要求。
2.植物蛋白的消化、吸收要比动物蛋白差。
动物蛋白相对与人类的营养结构比较吻合，其蛋白质的种类和结构更加接近人体的蛋白结构和数量，而且一般都含有人体必需的8种氨基酸，所以动物蛋白质比植物蛋白质营养价值高，更容易被消化。
植物蛋白是蛋白质的一种，来源是从植物里提取的，营养与动物蛋白相仿，但是更易于消化。
植物蛋白尽管一般不如动物蛋白好，但仍是人类膳食蛋白质的重要来源，含植物蛋白最丰富的是大豆。
动物蛋白质主要来源于禽、畜及鱼类等的肉、蛋、奶。
其蛋白质构成以酪蛋白为主，能被成人较好地吸收与利用。
更重要的是，动物性蛋白质的必需氨基酸种类齐全，比例合理，因此比一般的植物性蛋白质更容易消化、吸收和利用，营养价值也相对高些。
区别如下：乳清蛋白含有多种免疫活性物质，大豆蛋白不含免疫球蛋白和乳铁蛋白；乳清蛋白的氨基酸比例接近人体，吸收利用率较高，大豆蛋白吸收利用率较低；大豆蛋白嘌呤含量高于乳清蛋白；乳清蛋白无转基因问题，大豆蛋白多为转基因大豆；乳清蛋白通常价格高于大豆蛋白；乳清蛋白是优质的蛋白质来源，大豆蛋白是经济的蛋白质来源。