1.小智：男主角， 生于关东的真新镇，10岁，他朝气逢勃，目标是成为世界第一的神奇宝贝大师。

2.小光：是一个住在神奥地方的10岁女孩。

3.小刚：小刚曾是尼比市的道馆馆主，比其他人更了解神奇宝贝的种种知识。

4.武藏：梦想成为女明星，女演员，泼辣。

5.小次郎：为躲避未婚妻和父母的逼婚，离家出走加入了火箭队。

6.喵喵：曾为了一只女喵喵顽强地学会了只用两条腿走路、说话，后来输给了猫老大。

7.真司：是在神奥地区的男孩，他是小智在神奥地区的第一个劲敌。

8.小茂：是小智的宿敌，也是大木博士的孙子。

9.小霞：可爱，善良是她的性格，外加一点泼辣。

10.小遥：是小智在丰缘地区旅行时的同伴，个性善良活泼。

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1.小胜：小遥的弟弟，持著神奇宝贝领航员的人，附有很多专业知识。

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2.小瞬 ：是小遥的劲敌。

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3.大木博士：是关东地区的精灵博士。

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4.小望：小光在神奥地区的第一个劲敌。

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5.阿驯：小智的神奥地区的第二个劲敌。

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6.竹兰：神奥地区的冠军。

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7.银河团：是宠物小精灵中的最大、最强的反派角色，老大是赤木。

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8.坂木：火箭队的老大。

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9.健悟：小光的劲敌，和小光是青梅竹马。

20.琴音：来自城都地区的训练家。

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1.和也：来自城都地区的饲育家。

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2.千里和美津子：小遥和小胜的父母。

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3.彩子：小光的妈妈。

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4.内木博士：橘子群岛的神奇宝贝女研究员。

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5.空木博士：城都地区的神奇宝贝研究员。

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6.小田卷博士：丰缘地区的名研究员。

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7.山梨博士：居住在神奥地方真砂镇的研究神奇宝贝的进化的研究员。

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8.乔伊小姐：各地神奇宝贝中心的女护士，皆有亲戚关系，每个人长相都很相似。

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9.君莎小姐：各地的女警察，跟乔伊一样。

30.薇薇安：丰缘地方的华丽大赛主持人。

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1.莉莉安：关都地方的华丽大赛主持人。

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2.百安：神奥地方的华丽大赛主持人。

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3.鲤鱼王大叔：游走各地，专门骗钱的神奇宝贝小贩。

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4.开拓之脑：掌管对战开拓区各个设施的首脑。

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5.亚希达：对战开拓区的设立人即老板。

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6.达马岚其会长：神奇宝贝联盟的会长。