建兴十二年（234年）八月，诸葛亮病故于五丈原（今宝鸡岐山境内），享年五十四岁。
杨仪等率军还，姜维等遵照诸葛亮遗嘱，秘不发丧，缓缓退军。
司马懿率军追击，见蜀汉军帅旗飘扬，孔明羽扇纶巾坐在车里。
司马懿怀疑是孔明用计诱敌，赶紧策马收兵，于是便有“死诸葛吓走活仲达”一事。
在撤退途中，诸葛亮就忧虑呕血而亡，以现代眼光判断，诸葛亮晚年很可能得了肺结核和肝硬化之类的疾病。
原因如下：
1.肺结核和肝硬化之类的疾病会因肺部疾病大咯血或肝硬化后期门静脉破裂出血以致死亡。
2.诸葛亮长期以来，劳逸不平衡，营养与精力消耗不平衡，再加上后期政治上处境艰难，军事上进退维谷，因而造成情志上的郁郁寡欢。
这些都是他患肺脏或肝脏疾病的原因。
3.诸葛亮以忠君扶蜀为先，把自身的健康放在一边，既不锻炼，也不习武。
为了一统天下，诸葛亮常常要深谋远虑，运筹帷幄，既劳精又费神。
4.诸葛亮习惯于晚睡早起，一生谨慎小心，军中事无巨细，都要事必躬亲，导致精疲力竭。