国家行政机关的结构是指构成国家行政机关的各要素的排列组合方式。

行政机关的结构主要是指行政机关的层次结构与部门结构，又称纵向结构和横向结构。

决定纵向结构形式的两个重要因素，一是管理层次，一是管理幅度。

所谓管理层次，就是纵向结构的等级层次，有多少等级层次就有多少管理层次。

如我国行政机关分为中央政府、省政府、县政府、乡政府四个层次。

每级政府又有若干管理层次，如国务院有部、司、处等层次；省政府有厅、处、科等层次。

所谓管理幅度，是指一级行政机关或者一个领导人直接领导和指挥的下级单位或人员的数目。

行政机关的部门结构指的是同级政府相互之间和每级政府各组成部门之间，构成协调的平行关系，这种横向排列组合方式就是行政机关的部门结构。

如各省、直辖市、自治区政府之间，部内部各司之间，厅内各处之间，都是一种平行协调关系，共同对一个上级负责，这样就构成行政机关的横向结构。