水位太高很容易呛水，水位的高度是背甲的长度最为适宜，随着个体成长可以逐渐加深水位，水龟在水中生活，养龟水深一般比龟背稍高的深度即可，无须太深，最多不要超过龟背高度的2倍,最好可以提供一块高出水面的石头，让龟爬上去晒背。
龟需要阳光，如果完全室内饲养，要经常让他晒太阳，每天十多分钟。
建议饲养在东南面可以晒到阳光大约1到2小时的地方，并提供遮阳条件，免得中暑。
鉴于高密度集约化养龟条件下，龟的摄食量和排泄物都较多，而水温又较高，即使投喂的饲料是绿色饲料，其对水质的污化速度也较快，水体中易产生较多有害物质，尤以氨化亚硝酸盐及H2S危害较重，而通过泼洒和底施光合细菌，即可有效地改善水质 ，减少有害物质。
用高锰酸钾溶液对饲养容器浸泡消毒，同时在投喂的食物中拌入适量的抗生素，提高龟的抵抗力；将龟在质量分数为百分之一的奇霉素溶液中饲养一段时间；用质量分数为百分之四的食盐水浸洗病龟40至60分钟；患处涂抹的质量分数为百分之五聚维酮碘溶液；干养时可以控制水霉菌在鳄龟身上的繁殖，但要适时为鳄龟喷些水，防止干裂；多晒晒太阳，抑制水霉菌的生长。
鳄龟不怕严寒，也不怕突热。
其最佳生长温度为28到30度，水温12度以下进入浅冬眠状态，水温6度以下进入深睡状态。
水温1度以上可以正常越冬。
即使在零下五度的冰层下水中也不至于冻死。
它们靠身体积累的脂肪层越冬，在冰下它们通过皮肤呼吸和完全开口的池殖腔呼吸。