优点：
1.转基因技术不但可以把不同植物的基因进行组合，而且还可以把动物的基因，甚至人的基因组合到植物里去；
2.通过转基因技术可培育高产、优质、抗病毒等特性的作物新品种，以减少对农药、化肥和水的依赖，降低农业成本，大幅度地提高单位面积的产量，改善食品的质量，缓解世界粮食短缺的矛盾；
3.利用转基因技术生产有利于健康和抗疾病的食品；转基因食品可以摆脱季节、气候的影响，让人们一年四季都可吃到新鲜的瓜菜。
缺点：
1.科学家研究发现，有些转基因生物产品可能含有有毒物质和过敏源，会对人体健康产生不利影响，严重的甚至可以致癌或导致某些遗传疾病；
2.大量的转基因生物进入自然界后很可能会与野生物种杂交，造成基因污染，从而影响到生物多样性的保护和持续利用，转基因作物的亲缘野生种成为杂草或超级杂草；
所谓转基因食品， 就是通过基因工程技术将一种或几种外源性基因转移到某种特定的生物体中，并使其有效地表达出相应的产物(多肽或蛋白质)，此过程叫转基因。
以转基因生物为原料加工生产的食品就是转基因食品。
根据转基因食品来源的不同可分为植物性转基因食品，动物性转基因食品和微生物性转基因食品。
转基因食品营养与普通食品可能没有什么不同，营养价值相差不大但是许多食品生物本身就能产生大量的毒性物质和营养因子，如蛋白质抑制剂、溶血栓、神经毒素等以抵抗病原菌和害虫的入侵。
现有食品中毒素含量并不一定会引起毒效应，当然如果处理不当，某些食品(如木薯)能引起严重的生理问题甚至死亡。
在转基因食品加工过程中由于基因的导入使得毒素蛋白发生过量表达，产生各种毒性，从理论上讲任何基因转入的方法都可能导致遗传工程体(GMO)产生不可预知的变化，包括多向效应。
通过转基因技术可增强作物抗虫害、抗病毒等的能力。
提高农产品的耐贮性，延长保鲜期，满足人民生活水平日益提高的需求可使农作物开发的时间大为缩短。
可以摆脱季节、气候的影响，四季低成本供应。
打破物种界限，不断培植新物种，生产出有利于人类健康的食品。
转基因食品的弊：转基因技术本身还是存在一些不能确证但却危害巨大的隐患，包括对生态环境和公众健康的威胁。
转基因食物从1993年出现到现在，并未经过长期的安全性试验，还存在许多不确定因素。