一般，凡是在池塘中可以养殖的鱼类在藕田中均可养殖，主要有草鱼、鲢鱼、鲤鱼、鲫鱼等。
另外，彭泽鲫等生长较快的鱼类，是藕田养殖的良好品种。
由于藕田水面中光线较差、温度较低，应以吃食性鱼类为主、滤食性鱼类为辅。
另外，藕池中鱼类的放养密度应根据鱼的种类、放养规格、水质状况及管理水平决定，一般放养大规格鱼种应控制在二百尾每亩到三百尾每亩，放养革胡子鲶鱼种类应控制在六百尾每亩到八百尾每亩。
泥鳅喜欢栖息于静水的底层，常出没于湖泊、池塘、沟渠和水田底部富有植物碎屑的淤泥表层，对环境适应力强。
生活水温10至30度，最适水温为25至27度，故应属温水鱼类。
当水温升高至30度时，泥鳅即潜入泥中度夏。
冬季水温下降到5度以下时，即钻入泥中20至30厘米深处越冬。
泥鳅不仅能用鳃和皮肤呼吸，还具有特殊的肠呼吸功能；当天气闷热或池底淤泥、腐植质等物质腐烂，引起严重缺氧时，泥鳅也能跃出水面，或垂直上升到水面，用口直接吞入空气，而由肠壁辅助呼吸，当它转头缓缓下潜时，废气则由肛门排出。