需要公民带上有效的身份证到相关的派出所办理挂失手续以后，再带上本人有效的身份证原件，港澳通行证照片等资料申请补办的，异地补办港澳通行证还需要提供当地有效的居住证原件进行办理。
需提交下列材料：
1.提交符合《出入境证件相片照相指引》标准的申请人照片；
2.交验申请人居民身份证原件，申请人未满16周岁，也可交验居民户口簿；军人应交验军人身份证明。
上述身份证件须留存复印件或者电子扫描图片；
3.按规定提交或者核验指纹信息；
4.按照公安部有关规定在非常住户口所在地申请往来港澳通行证的，还须提交符合在非常住户口所在地申请条件的证明；
5.军人、登记备案的国家工作人员，应当提交本人所属单位或者上级主管单位按照人事管理权限审批后出具的同意办理出入境证件的函；
6.未实行按需申领护照地区的内地居民，还须按照有关规定出具相关证明材料。
对于港澳通行证丢失，是建议公民及时办理挂失的，虽然港澳通行证不可以被他人用于过关，但是其上面也具有公民相关的资料，是建议公民及时带上身份证原件、出入境照片、采集回执单到出入境部门申请重新办理的。
补办的话需要过几天，具体过几天，要询问出入境工作人员，有的地方可以即时补办，再携带身份证和户口簿到出入境办理。
1.在户籍地办理：本人带照片+照片回执去户口所在公安局出入境管理局办理，可以网上预约。
2.不在户籍地办理：就业人员（登记备案国家工作人员除外）要提供一年或以上有效的本市居住证（即办了至少一年的）、从申请月起倒数连续一年的本市社保证（断过、补交都不算）；高等院校在读学生要另加学校出具的证明和学生证。
如果你是登记备案国家工作人员，要拿申请回单位盖批核章。
2、按照预约时间带上证件去出入境管理局填表、交表。
3、按要求用银行卡付费。
4、领取办证回执。
5、在回执上所示领证日期或之后凭本人身份证和回执领取。
户籍地15个工作日，非户籍地须30个工作日。