原因有：
1.孔雀鱼生的小鱼颜色不同是因为孔雀鱼存在正常状态和白子状态。
如果是正常的雌孔雀鱼，在不知道雄孔雀鱼的情况下，生出来的小鱼百分之九十五的可能都是正常黑眼睛具有黑色素的小孔雀鱼。
2.如果雌鱼或者雄鱼是白子，那么小鱼里可能有一部分或者全部是白子，白子宝宝全身没有任何黑色素，鱼肉成娇嫩的淡粉色或者淡橙色，眼睛为红色，所以雌鱼即使临产，肚子里的白子宝宝也会成鲜红色或者暗红色并不会像普通那么深，虽然也可以看到眼睛，但是红色的眼睛也不会像黑色的明显，所以一般也是看体型和状态，并且日后比普通孔雀宝宝成活率低。
孔雀鱼：孔雀花?，俗名孔雀鱼，也称为凤尾鱼、彩虹花?、虹?、古比鱼等，是花?科花?属的一种热带鱼，雌雄鱼的体型和色彩差别较大，成年雄鱼身体瘦小，体长3至4厘米，体色绚烂多彩、体型优美；成年雌鱼体长5厘米左右，其尾柄及尾鳍占全身的三分之一以上，各鳍均较雄鱼的短。
孔雀鱼有的小鱼尾巴小是由于细菌感染引起的，孔雀鱼养殖方法具体如下：
1.选择鱼苗，选择体形匀称，身体短尾鳍宽大，品种特性明显的鱼苗，色彩浓艳鲜丽，比较有活力，选择合适的鱼缸进行喂养，要注意鱼的投放密度；
2.孔雀鱼喂养，可采取将一日量分1次至2次投喂的方式，每次投喂量宜在1小时至2小时内吃完，避免饲料一次投量过多，积存池底，败坏水质，随着金鱼的长大的投食量宜逐渐适当增加，但不能盲目投食；
3.孔雀鱼光照，最好把鱼缸放在有阳光照，照射1小时至2小时的地方，利用阳光的紫外线杀菌，起到防病的作用，这样可以减少疾病；
4.孔雀鱼换水，将鱼池底部的粪便和脏物连同陈水，用胶管轻轻吸出，清除水面灰尘及浮出的粪便，然后沿池壁徐徐注入等温的新水，保持水质的清洁，不能一次换水过多， 否则水质突然变化，会导致孔雀鱼的水质不适症发生。
因为孔雀鱼是卵胎生鱼，在体内受精，体内发育，发育成小鱼后排出体外。
孔雀鱼，又称孔雀花?，虹?。
我国东北部分地区称之为凤尾鱼，火炬，是?亚目，花?科，花?属的一种热带鱼，饲养难度较低。
原产于南美洲的委内瑞拉，巴巴多斯，巴西北部与圭亚那，作为观赏鱼引入新加坡，中国，日本，韩国，美国以及众多欧洲国家。
孔雀鱼体色绚烂多彩，体型优美自然，深受人们喜爱。
孔雀鱼分布于部分热带地区的河川下游，其野生栖息地呈现多样化，主要栖息于淡水流域及湖沼。
孔雀鱼繁殖能力很强，能耐受污染水域，有百万鱼的美称。
孔雀鱼性情温和，能与温和的中小性型热带鱼混养，平时活泼好动，寿命约1至2年。
纯种孔雀鱼分成五大品系草尾，蛇纹，马赛克，礼服，白金以及众多独立的表现型日本蓝，米卡立夫，拉朱利等。
孔雀鱼是杂食性小型鱼种，成鱼体长3至5厘米，由于孔雀鱼对环境的适应能力十分强大，目前全世界几乎随处都能见到它的芳踪。
它丰富的色彩，多姿的形状和旺盛的繁殖力，倍受热带淡水鱼饲养族的青睐。