1240年，南部地区的高等公爵明道加斯统一了立陶宛地区，建立立陶宛大公国。当时，基督教在欧洲日盛，但倔强的立陶宛成为最后一个非基督教国家。西面的天主教和东面的东正教都希望拿下立陶宛。

到1386年，天主教十字军陈兵立陶宛边境，雅盖沃大公随后带领立陶宛人皈依天主教。1387年，天主教成为国教。自此，欧洲长达千年的基督化正式完成。立陶宛获得一个新名字，天主教的“北境守护者”。维陶塔斯大公执政期间（1392～1430年）是立陶宛鼎盛时期，成为当时欧洲面积最大的国家之一，疆域北起波罗的海，南至黑海，涉及今天拉脱维亚、爱沙尼亚、俄罗斯、白俄罗斯、乌克兰、波兰、摩尔多瓦部分地区。

1569年，立陶宛和波兰合并，成立波兰-立陶宛联邦，国力先盛后衰，持续到18世纪晚期。

18世纪中后期开始，波兰-立陶宛联邦遭到沙俄、普鲁士、奥地利三国的联手瓜分，联邦最终瓦解。此后近两百年间，立陶宛进入到一段被反复征服的时期，不断遭受强国的侵略和占领。

1795年后，立陶宛逐步被沙俄吞并。沙俄强迫立陶宛人信奉东正教，立陶宛人用制作十字架的方式表示反抗。这就是著名的“十字架山”的由来。

第一次世界大战期间，德国占领立陶宛。1918年2月16日，立陶宛宣布国家重建，并建立独立的资产阶级共和国。2月16日成为立陶宛的第一个国庆日。1920年10月9日，波兰占领立陶宛首都维尔纽斯和东部地区，第二大城市考纳斯成为立临时首都。

1939年8月，苏联和德国签订秘密条约，立陶宛被划入苏联势力范围。1940年，苏军进驻立陶宛境内，事实占领了立陶宛。

第二次世界大战期间，1941年，苏德战争爆发，立陶宛又被纳粹德国占领。

随着二战形势变化，1944年，苏联军队再次占领立陶宛，立陶宛苏维埃社会主义共和国成立并加入苏联，成为苏联的一部分。1990年3月11日，立陶宛通过恢复独立宣言，宣布脱离苏联独立。3月11日成为立陶宛第二个国庆日。因而，立陶宛是一年过两次国庆的国家。

1991年9月17日，立陶宛加入联合国。2004年3月29日，立陶宛加入北约，5月1日成为欧盟成员国