有区别，区别在于，防疫证明和检疫证明都是与进出口商品检疫相关的文件，但它们的用途和内容略有不同。

防疫证明是针对进口商品的，证明该商品已经过境该国的口岸，并且符合该国的防疫要求。在某些情况下，防疫证明也可以用于证明商品经过HFQ（卫生检疫）和WS（植物检疫）检验，符合该国的相关标准。

检疫证明则是在商品进入一个国家或地区时签发的，证明该商品符合该国的检疫要求，并且已经通过相应的检验。检疫证明通常包括商品的名称、数量、包装方式、生产厂家等信息，以及检验标准和日期等。

因此，防疫证明和检疫证明的主要区别在于证明的对象和内容不同。防疫证明用于证明商品进口符合该国的防疫要求，而检疫证明用于证明商品符合该国的检疫标准。