大蛇丸对三代的感情有很多层，首先三代养育他长大，培养他成为三忍。

有一些对恩师的感激（从大蛇丸和自来也小时候的事可以看出）。

但是大蛇丸从小就心术不正，三代对他管束很严，很少得到来自三代的夸奖。

时常让他向当时跟鸣人一样吊车尾似的自来也学习，让他很不服气。

之后大蛇丸为了变强，开始研究禁术，开始做人体试验。

三代是知道的，一直反对和阻挠大蛇丸的研究，直到最后将大蛇丸驱逐出村子。

所以大蛇丸对三代的感情渐渐变为了憎恨。

他进攻火影村为了就是证明自己，和杀掉三代，让他知道自己才是他最出色的弟子，自己研究的禁术才是王道。

再说三代，三代对自己的三个弟子是非常疼爱的（从三忍小时候和三代的合照），他老人家性格就这样（这点我们很容易看出）。

而大蛇丸作为三代最有天赋的弟子，三代能不喜欢他么。

答案是肯定的，而且三代一直将大蛇丸照顾长大，是亦父亦师的存在，没有感情是假的。

但是大蛇丸不走正路，与三代的理念背道而驰。

当得知大蛇丸研究禁术时，三代还劝过他回头，奈何大蛇丸那时对他已经有记恨，逃离的村子。

那时起他心中就有愧疚，觉得自己没有教导好自己的弟子。

在大战中，三代确实难以下手杀掉大蛇丸，但是为了村子还有自己火影所承担的责任，还是尽力去战斗了，那时肯定是没有放水的，因为三代肩上扛着全村的希望，不可能放水。

最后的结果是将大蛇丸双手封印，那时三代状态已经是强弩之末了，使出了最后的杀手锏后将大蛇丸双手封印，已经将大蛇丸费去了忍术。

最后没有杀死大蛇丸是因为实在没有力气了还是因为三代心中对弟子的情感导致没有下杀手，我们已经不得而知了。

但是我们知道，三代是一个令人尊敬的老师，一位令人尊敬的火影。