氨氮超标处理方法常分为两类：化学法处理和生物法处理 。
化学法处理包括：
1.氨氮去除剂的投加，氨氮去除剂是一种含有特殊架状结构的高分子无机化合物，对氨氮的去除率达百分之九十以上；
2.吹脱法，利用氨氮在水中的平衡关系，调节pH到碱性，使得氨氮以非离子态存存在；
3.折点加氯法，利用氨氮和氯反应最终生成氮气从水中脱除。
氯的投加量依照加氯曲线。
生物处理法：就是我们常说的生物脱氮，主要包括氨化、硝化、反硝化最终以氮气从水中脱出，生物脱氮现在有很多成熟的工艺，在水处理中非常常见。
显色剂是纳氏试剂，即碘化汞钾。
纳氏试剂分光光度法测定水中氨氮的原理：在水样中加入碘化汞和碘化钾的强碱溶液，则与氨反应生成黄棕色胶态化合物，此颜色在较宽的波长范围内具有强烈吸收，通常使用410到425纳米范围波长光比色定量。
氨氮主要源于有机氮污染，是水体富营养化的重要指标，而氨氮超标在微生物作用下，可分解成亚硝酸盐氮，最终成为硝酸盐氮，是微生物对水体的精华过程，但是一方面微生物的大量繁殖，例如藻类过量繁殖，引起水华赤潮，其代谢产物，例如藻毒素有致肝癌等毒性。
另一方面当水中的亚硝酸盐氮过高，饮用此水将和蛋白质结合形成亚硝胺，是一种强致癌物质。
长期饮用对身体极为不利。