毕业证是一样的。
不同：
1.自主招生又称自主选拔，是高校选拔录取工作改革的重要环节。
2003年，中国教育部开始推行自主招生，结束了此前高校只能在每年同一时间招考的历史。
高中毕业生通过考核后，可提前确定意向高校的录取名额，并在参加高考后享受降分优惠。
根据教育部要求，自主招生人数不能超过试点学校年度本科招生计划总数的百分之5。
入选考生均须参加全国统考，成绩达到生源所在省、自治区、直辖市、确定的与试点学校同批次录取控制分数线的，省级招办应向考生选报的试点学校投档；试点学校进行综合评价、自主选拔录取。
2.统招一般指全日制普通中等专业学校统一招生选拔考试，依照《全国普通高等学校招生计划》内统一招录，学习形式为普通全日制。
统招生毕业时由政府人事局发放报到证。
是否统招生是以学信网学历证书电子注册备案表上的学习形式是否“全日制”来定论。
一般自主招生都是高职高专的学校进行，适合低分的学生参加。
自主招生除了时间跟难度和高考不同，其他都一样，包括毕业证和学位证。
自主招生院校的招生简章中，都明确注明了自主招生毕业生待遇：修业期满，达到毕业要求，颁发教育部网上注册的“普通高等学校专科学历证书”。
区别：
1.自主招生：又称自主选拔，是高校选拔录取工作改革的重要环节，2003年，中国教育部开始推行自主招生，结束了此前高校只能在每年同一时间招考的历史；
2.自主招生考试应将安排在全国统一高考后进行，自主招生试点高校或将仍允许安排笔试环节；
3.通过高考自主招生笔试和面试之后，可以得到相应的高考降分政策，一般通过考试后招生学校会与其签订招生考试合同，签订合同后，一般可享受降低十分至几十分录取的优惠政策，另外还有专业选择方面的优惠，具体合同要与学校谈；
4.统招：一般指全日制普通高校统一招生选拔考试，依照《全国普通高等学校招生计划》内统一招录，学习形式为普通全日制，统招生毕业时由政府人事局发放报到证，统招生是以学信网学历证书电子注册备案表上的学习形式是否是普通来定论；
5.国家承认自主招生项目，认可其毕业资格。