1.首次办理须本人至户籍所在地的出入境管理处提交申请。
2.携带材料。
首次办理所需的材料有居民身份证和户口簿的原件及复印件半身证件照：标准护照证件照，同时分别申请赴香港、澳门的签注。
只去香港则申请香港签注，只去澳门则申请澳门签注，如果香港、澳门都去，则两地签注都要申请。
3.现场办理。
备齐准备的资料，领号码牌。
排队受理。
4.办理时限。
一般顺利的话两周左右就可以收到首次办理的护照和通行证了。
港澳通行证分为6个种类。
个人旅游G：有效期可为三个月或一年，次数可为一次或两次，一般每次最长逗留7天；团队旅游L：分为三个月一次或两次、一年一次或两次，每次逗留不超过7天；探亲T：分为三个月一次有效，每次可逗留14天；或三个月多次有效，逗留不超过自首次进入之日起90天；商务S：分为三个月一次、三个月多次、一年多次，每次逗留不超过7天；其他Q：三个月一次或两次、一年一次或两次，每次逗留不超过14天；逗留D：多次有效，出境有效期根据香港或者澳门有关部门批准的期限签发。
港澳通行证证件号以W开头，有效期为5年；以C开头，有效期为10年；在有效期内使用完次数可再次申请。
自 2013年6月1日起，广东省将恢复香港、澳门个人游签注可以同时申请的做法，此举措是按照公安部统一规定，但由于个人游“两个月一次”的澳门政策，如申请时澳门个人游签注距上一次申办间隔不足两个月的，则不能同时申请，只能单独申请赴香港个人游签注。
按目前的规定，只能申请三个月一次或一年一次的澳门签证，而且两个月才批准一次，即11月去过一次澳门，要到第二年1月才能再申请去澳门。
港澳通行证俗称双程证，是由中华人民共和国公安部出入境管理局签发给中国内地居民因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。